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SARS CoV2 RT-PCR cycle threshold (Ct) values and the risk of developing acute respiratory distress syndrome in patients with Covid19


Aoub Rabhi
Hamza Letlout
Sadjia Mahrane
Selma Laalia Nouar
Zhor Guechi
Mohamed El Hadi Cherifi

Abstract

Background: SARS-CoV-2 viral loads may aid in the risk stratification of patients with COVID-19. Methods. 486 patients tested positive for SARS Cov2 by real time RT-PCR were included in this study. All the tests were performed on nasopharyngeal swabs during the first week after symptom onset using Sansure Biotech™ SARS Cov2 real time RT-PCR kits. Patient’s condition was monitored over a period of one month after the onset of symptoms.


Results: The mean Ct value in the group of patients who developed acute respiratory distress syndrome (ARDS +) was 18.27 (95% CI: 17.43-19.10) while for the ARDS- group it was 33.06 (95% CI: 32.77-33.34).


Discussion: The Ct values in the group of patients who developed ARDS (ARDS +) were significantly lower than those observed in the ARDS- group. By setting a cut-off value, the determination Ct values (on a qualitative technique) from nasopharyngeal swabs performed during the first week after symptom onset will assist clinicians in risk-stratifying patients.


Conclusion: Our data show that the determination of SARS CoV2 RT-PCR cycle threshold values from nasopharyngeal swabs performed during the first week after symptom onset may aid in the risk stratification of patients with COVID-19


 


French title: Valeurs des cycles seuils (Ct) de la RT-PCR du SARS CoV2 et le risque de développer un syndrome de détresse respiratoire aiguë chez les patients atteints de Covid19


Contexte: Les charges virales du SRAS-CoV-2 peuvent aider à la stratification du risque chez les patients atteints de COVID-19.


Méthodes: 486 patients testés positifs pour le SRAS-CoV2 par RT-PCR en temps réel ont été inclus dans cette étude. Tous les tests ont été réalisés sur des écouvillons nasopharyngés au cours de la première semaine après l'apparition des symptômes à l'aide des kits de RT-PCR en temps réel Sansure Biotech™ SARS Cov2. L'état des patients a été suivi sur une période d'un mois après l'apparition des symptômes.


Résultats: La valeur moyenne de Ct dans le groupe de patients ayant développé un syndrome de détresse respiratoire aiguë (SDRA +) était de 18,27 (IC 95 % : 17,43-19,10) tandis que pour le groupe (SDRA -) elle était de 33,06 (IC 95 % : 32,77-33,34).


Discussion: Les valeurs de Ct dans le groupe de patients ayant développé un SDRA (SDRA +) étaient significativement plus basses que celles observées dans le groupe (SDRA-). En fixant une valeur seuil, la détermination des valeurs de Ct (selon une technique qualitative) à partir d'écouvillons nasopharyngés réalisés au cours de la première semaine après le début des symptômes aidera les cliniciens à stratifier les patients en fonction du risque.


Conclusion: Nos données montrent que la détermination des valeurs des cycles seuils de la RT-PCR du SARS Cov2 à partir d'écouvillons nasopharyngés réalisés au cours de la première semaine après l'apparition des symptômes peut aider à la stratification du risque chez les patients atteints de COVID-19.


Journal Identifiers


eISSN: 2437-0665