The Distribution Of Bovine Leukemia Virus Genotypes In Cattle From Japan And Diagnostic Performance Of Agar Gel Immuno Diffusion (Agid) And Polymerase Chain Reaction (Pcr) Tests

  • Y Asfaw
  • H Sentsui

Abstract



A study to investigate the types and distribution of bovine leukemia virus (BLV) genotypes and to estimate diagnostic test performance of agar gel immunodiffusion (AGID) was conducted on 807 cattle drawn from 68 farms found in 16 prefectures in Japan from June 2002 to December 2003. AGID test on serum samples and polymerase chain reaction (PCR), to detect BLV provirus, from peripheral blood lymphocytes (PBL) were performed. To identify genotypes, restriction fragment length polymorphism (RFLP) was done on the 444 bp fragment of env gene on PCR amplified product using endonucleases Bcl I, Hae III, PVu II, BamH I, and Bgl I. In this study, six genotypes were identified. These are genotypes 1, 2, 3, and 5. Two of the genotypes were unusual in that they exhibited unique band fragmentation; we named these genotypes 2-3 and 3-4. Genotypes 1, 3, and 5 are the most dominant types in Japan, which are recorded in 48.3%, 32.7%, and 16.9% of tested cattle, respectively. The sensitivity and specificity of AGID was found to be 89.3% and 58.8%, respectively. The test agreement between AGID and PCR was 0.48.
Une étude pour enquêter sur les types et la répartition des génotypes de virus de la leucémie bovine (VLB) et pour évaluer la performance du test de diagnostic d\'immunodiffusion en gélose (AGID) a été menée sur 807 bovins issus de 68 fermes dans 16 préfectures au Japon pendant la période allant de juin 2002 à décembre 2003. On a effectué le test AGID sur des prélèvements de sérum et le test PCR pour détecter le provirus VLB à partir des lymphocytes du sang périphérique. En vue d\'identifier les génotypes, le test RFLP a été effectué sur le fragment 444 bp du gène env sur le produit amplifié par PCR en utilisant les endonucléaes Bcl I, Hae III, PVu II, BamH I et Bgl I. Dans la présente étude, six génotypes étaient identifiés, à savoir: les génotypes 1, 2, 3 et 5. Deux de ces génotypes étaient peu communs dans la mesure où ils exposaient une fragmentation de bande unique ; nous avons appelé ces génotypes 2-3 et 3-4. Les génotypes 1, 3 et 5 sont les types prédominants au Japon que l\'on a relevés chez 48,3%; 32,7% et 16,9% des bovins testés respectivement. La sensibilité et la spécificité de l\'AGID étaient de 89,3% et 58,8% respectivement. La concordance entre les tests AGID et PCR était de 0,48%.
Bulletin of Animal Health and Production in Africa Vol. 55 (4) 2007: pp. 244-253
Published
2008-06-27
Section
Articles

Journal Identifiers


eISSN: 0378-9721